„Nach einer gründlichen Marktbewertung haben wir festgestellt, dass Lenovo GOAST ideal zu unseren Anforderungen passt. Durch die Wahl einer vorgefertigten HPC-Lösung, die speziell für Genomik und Bioinformatik entwickelt wurde, konnten wir die erheblichen Kosten und die Komplexität des Entwurfs und Aufbaus unseres eigenen Clusters vermeiden.“
Seit Ende der 2000er Jahre haben NGS-Technologien die Kosten und den Zeitaufwand für die DNA-Sequenzierung drastisch reduziert. Dank der Fortschritte in der High-Performance-Computing-Technologie (HPC) ist es nun möglich, Genomsequenzierungen für ganze Populationen durchzuführen.
Allerdings stellt die Verwaltung des enormen Datenvolumens und der Datengeschwindigkeit – die zwischen 10 und 300 GB pro Probe liegt – immer noch große technische Herausforderungen dar. Forscher müssen die Rohdaten mehrfach filtern, um sie für die nachgelagerte klinische Analyse nutzbar zu machen – ein anspruchsvoller und ressourcenintensiver Prozess.
Abdulrahman Alasiri, Direktor für biomedizinische Informatik bei Novo Genomics, erklärt: „Unser oberstes Ziel ist es, jedem Bürger im Königreich Zugang zu personalisierten medizinischen Behandlungen basierend auf seinen Genen bieten zu können. Bisher gab es im Land keine Einrichtung, die Genomanalysen in diesem Umfang durchführen konnte. Als schlankes Start-up war es unser Ziel, eine HPC-Infrastruktur bereitzustellen, die es uns ermöglichen würde, die neuesten Sequenzierungstechniken erstmals nach Saudi-Arabien zu bringen.“
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